62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1019 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 		 299 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  49.17 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  50.5 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  45.48 
 
 		 330 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  46.75 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  46.62 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  46.64 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  40.8 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  43.38 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  39.79 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.16 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  39.86 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  37.71 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.69 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  39.02 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.83 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.06 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  38.02 
 
 		 292 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.79 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.29 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.65 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.24 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.33 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.31 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  29.33 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.15 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  31.39 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.34 
 
 		 288 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  29.86 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  33.33 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  32.27 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.58 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  32.64 
 
 		 356 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  25.29 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.26 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.94 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.64 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  30.45 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.03 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.4 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  26.75 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.2 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.23 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.13 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.05 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  28.77 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.23 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  31.07 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  32.63 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  36.42 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.33 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  30 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.87 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.94 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  50 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  25.89 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  26.67 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  22.64 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  47.27 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  25 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  27.12 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  24.83 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>