61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1660 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  100 
 
 		 346 aa  717    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  48.08 
 
 		 366 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  50.72 
 
 		 291 aa  324  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  49.24 
 
 		 288 aa  316  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  48.98 
 
 		 302 aa  315  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  49.4 
 
 		 288 aa  315  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  48.22 
 
 		 290 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  46.9 
 
 		 288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  46.97 
 
 		 299 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  47.4 
 
 		 309 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  47.58 
 
 		 294 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  45.94 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  46.35 
 
 		 302 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  47.11 
 
 		 312 aa  295  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  46.59 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  45.86 
 
 		 293 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  44.79 
 
 		 316 aa  288  9e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  47.13 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  40.81 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  42.86 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  41.03 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  37.95 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  39.34 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  36.87 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  45.24 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  47.19 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.19 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  25.69 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.11 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.98 
 
 		 294 aa  89.7  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  29.41 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  29.2 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  29 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.3 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  27.17 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  27.11 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  24.54 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2735  hypothetical protein  26.9 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  49.25 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.21 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  49.28 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.48 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  25.53 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  57.14 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  24.21 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  59.62 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  28.74 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.55 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  25.17 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  50 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  50 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  49.09 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.08 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  50 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  36.05 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  44.07 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  50 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.21 
 
 		 291 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.91 
 
 		 302 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  30.26 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  45.83 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>