174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4632 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4632  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
155 aa  313  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  52.94 
 
 
339 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
361 aa  156  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  48.41 
 
 
363 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.52 
 
 
341 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.67 
 
 
348 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.87 
 
 
348 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  44.59 
 
 
357 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  38.46 
 
 
297 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.08 
 
 
316 aa  100  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.81 
 
 
312 aa  98.2  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.28 
 
 
301 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.69 
 
 
305 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.82 
 
 
310 aa  95.5  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  39.69 
 
 
306 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  39.69 
 
 
306 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  39.69 
 
 
306 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  38.93 
 
 
306 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40.46 
 
 
318 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  38.93 
 
 
306 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.85 
 
 
309 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  39.69 
 
 
306 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  39.69 
 
 
306 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  38.06 
 
 
293 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  38.17 
 
 
306 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.81 
 
 
344 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  38.93 
 
 
306 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  47.25 
 
 
312 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.09 
 
 
309 aa  90.5  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.15 
 
 
312 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  38.06 
 
 
293 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  34.11 
 
 
333 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.93 
 
 
306 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  46.15 
 
 
312 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.69 
 
 
305 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.84 
 
 
311 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.71 
 
 
312 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.15 
 
 
339 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  41.6 
 
 
314 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.22 
 
 
321 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.72 
 
 
323 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.45 
 
 
319 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.01 
 
 
320 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  36.42 
 
 
300 aa  84.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.26 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.31 
 
 
316 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.89 
 
 
305 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  45.56 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  40.16 
 
 
316 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  36.17 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.19 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.5 
 
 
322 aa  77.8  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.26 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.92 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  43.53 
 
 
364 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.6 
 
 
297 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.37 
 
 
338 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  31.33 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.33 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  31.33 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0886  microcin immunity protein MccF  29.37 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.58 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.85 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  34.01 
 
 
328 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0829  microcin immunity protein MccF  28.67 
 
 
334 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.181622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  32.19 
 
 
328 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  41.38 
 
 
328 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.87 
 
 
304 aa  70.5  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  43.37 
 
 
328 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  31.79 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.46 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.56 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.87 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.83 
 
 
333 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.49 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1955  microcin C7 self-immunity protein MccF  31.51 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1783  microcin immunity protein  30.28 
 
 
333 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0982524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2033  microcin immunity protein MccF  35.23 
 
 
333 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.56 
 
 
329 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.85 
 
 
309 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.04 
 
 
313 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1889  microcin immunity protein MccF, putative  33.98 
 
 
317 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.953828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1766  microcin immunity protein  29.36 
 
 
333 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  37.33 
 
 
298 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.57 
 
 
348 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  29.36 
 
 
333 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  29.36 
 
 
333 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  29.36 
 
 
333 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3373  microcin C7 self-immunity protein MccF  29.45 
 
 
333 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00948575  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.55 
 
 
339 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.53 
 
 
321 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1993  microcin C7 self-immunity protein MccF  31.88 
 
 
343 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3018  microcin C7 self-immunity protein  29.88 
 
 
343 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.21 
 
 
311 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.53 
 
 
321 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3266  hypothetical protein  30.71 
 
 
343 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.1 
 
 
296 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3281  MccC family protein  30.71 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.7 
 
 
299 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>