34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1933 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  184  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  60.44 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  52.75 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  52.75 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  52.75 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  61.7 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  51.65 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  62.37 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  42.71 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  40.48 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  29.67 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  34.41 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2756  hypothetical protein  29.67 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0253096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  42.39 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  31.87 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  29.67 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  29.76 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  35.9 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  31.52 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6024  hypothetical protein  34.12 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2820  hypothetical protein  33.72 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392783  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0334  hypothetical protein  32.47 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.479638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0980  hypothetical protein  26.51 
 
 		 96 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>