21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1358 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  59.38 
 
 
96 aa  114  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  55.21 
 
 
100 aa  111  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  55.21 
 
 
96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  56.25 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  56.58 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  42.11 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  35.79 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  35.79 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  49.38 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  32.98 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  37.89 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  35.37 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  30.85 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  29.79 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  29.47 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  30.53 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>