33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1978 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  184  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  71.58 
 
 
95 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  60.44 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  60 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  66.32 
 
 
95 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  58.95 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  58.95 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  47.87 
 
 
95 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  43.62 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  43.16 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  38.95 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  41.05 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  38.95 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  42.11 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  38.95 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  38.54 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  37.8 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  37.89 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  36.84 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  40.22 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  36.17 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  37.89 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2756  hypothetical protein  29.35 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0253096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  29.35 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2820  hypothetical protein  40.7 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392783  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  44.21 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  41.25 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  26.09 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6024  hypothetical protein  36.05 
 
 
183 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0980  hypothetical protein  29.55 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137555  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  27.85 
 
 
124 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>