31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0429 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  100 
 
 		 95 aa  181  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  47.87 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  51.65 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  43.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  47.87 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  51.06 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  41.49 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  38.3 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  38.3 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  38.3 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  39.36 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  33.68 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  39.74 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  35.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  34.04 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  37.23 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  35.48 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0980  hypothetical protein  29.79 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  30.85 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  32.14 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  29.89 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  33.78 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2756  hypothetical protein  25.27 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0253096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  25.27 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0334  hypothetical protein  31.91 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.479638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  27.66 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  36.62 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  29.79 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>