17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2756 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2756  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0253096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  29.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  29.35 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0871  hypothetical protein  60.87 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.808246  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1336  hypothetical protein  58.7 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  25.27 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  29.76 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0535  hypothetical protein  57.14 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  30.85 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1747  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0520299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  32.63 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  56.25 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  28.26 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  22.83 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  22.83 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  22.83 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>