29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2742 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  100 
 
 
95 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  98.95 
 
 
95 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  58.95 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  66.32 
 
 
95 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  52.75 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  60 
 
 
95 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  38.3 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  39.13 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  34.74 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  36.84 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  38.95 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  35.79 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  36.84 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  36.17 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  34.74 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  32.63 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  38.03 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  36.84 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  34.74 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  31.46 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6024  hypothetical protein  33.72 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  25.26 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  37.36 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  22.83 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2756  hypothetical protein  22.83 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0253096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>