25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1890 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  41.76 
 
 
96 aa  77  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  43.96 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  37.89 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  45.45 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  38.54 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  39.13 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  34.62 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  28.89 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  32.26 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  36.96 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  36.71 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  32.98 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  30.11 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  24.18 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  30.86 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  37.08 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  31.17 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  23.81 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  28.05 
 
 
106 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2756  hypothetical protein  28.05 
 
 
155 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0253096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>