19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2053 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  38.95 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  35.42 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  36.17 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  34.04 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  35.23 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  38.2 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  41.57 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  28.89 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  35.42 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  31.46 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  31.25 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  29.17 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  31.46 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  30.21 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  31.46 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  29.47 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>