20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1149 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  190  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  41.05 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  40.48 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  33.68 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  38.95 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  36.17 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  34.07 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  38.75 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  38.3 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  37.89 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  36.71 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  29.03 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  32.98 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  28.4 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>