26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2059 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  187  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  39.36 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  38.71 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  43.48 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  41.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  42.05 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  35.11 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  35.11 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  35.11 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  35.11 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  41.3 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  32.63 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  36.78 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  36.17 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  35.11 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1408  hypothetical protein  34.18 
 
 
232 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  0.630193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  31.91 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  35.63 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  29.33 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  31.91 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  31.91 
 
 
96 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  35.53 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  27.91 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  27.78 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>