22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1478 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  181  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  42.71 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  38.95 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  41.49 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  43.96 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  39.36 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  40.22 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  42.5 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  38.95 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  32.63 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  34.07 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  31.58 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  29.47 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0980  hypothetical protein  26.6 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  34.41 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  31.71 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  28.42 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6024  hypothetical protein  31.18 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119535 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  26.32 
 
 
96 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>