14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6024 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6024  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5775  hypothetical protein  29.68 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2356  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000744981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  36.05 
 
 		 95 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  33.72 
 
 		 95 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  35.63 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  31.18 
 
 		 95 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  31.91 
 
 		 581 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1934  hypothetical protein  27.96 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.121616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>