23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0912 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  186  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  80.21 
 
 
96 aa  158  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  61.46 
 
 
96 aa  120  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  57.89 
 
 
100 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  61.84 
 
 
96 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  43.16 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  40 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  41.05 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  42.11 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  35.11 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  39.78 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  30.11 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  30.21 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0388  hypothetical protein  34.88 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  28.42 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  34.78 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  28.12 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>