24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0890 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  61.05 
 
 
96 aa  123  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  57.89 
 
 
96 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  55.21 
 
 
96 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  52.08 
 
 
96 aa  110  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  53.12 
 
 
96 aa  107  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  53.95 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  38.95 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  34.74 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  34.74 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  34.74 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  37.89 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  29.67 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  29.89 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  25.26 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  33.68 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  29.17 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  32.61 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  28.09 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0388  hypothetical protein  24.42 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  28.05 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  23.81 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>