19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4140 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4140  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.187418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  51.58 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  37.89 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  34.04 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2053  hypothetical protein  35.42 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  34.74 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  34.74 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  34.74 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  31.52 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  27.47 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>