18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0335 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  189  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  41.49 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  38.27 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  32.26 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2772  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  32.14 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  24.18 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  29.47 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0579  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2813  hypothetical protein  34.67 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  25.26 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  28.42 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  25.26 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  25.26 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>