15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0357 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0357  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000942167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1690  hypothetical protein  40.86 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1478  hypothetical protein  40.22 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0165306  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0335  hypothetical protein  32.26 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  35.48 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  29.76 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1890  hypothetical protein  32.98 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  35.37 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1149  hypothetical protein  29.03 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000282365  normal  0.17162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  25.53 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  29.03 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  29.41 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  26.09 
 
 
96 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  30.99 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  29.21 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>