More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0540 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0540  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  38.78 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  39.17 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  39.17 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  39.17 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.6 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  38.78 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  39.08 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  38.75 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  38.49 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  38.49 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  38.49 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  37.39 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  38.08 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  35.59 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.32 
 
 		 232 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  34.75 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  36.68 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  36.05 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  37.78 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  33.78 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  37.55 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  35.81 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  37.45 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  37.93 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  37.86 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  36.96 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  37.86 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  36.8 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  37.93 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  37.93 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  37.93 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  33.47 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  34.07 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  37.5 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  37.5 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  37.5 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  37.5 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  35.87 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  35.87 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  37.5 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  37.5 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  35.43 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  36.05 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  36 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  34.84 
 
 		 223 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  34.84 
 
 		 223 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  32.89 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  34.23 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  32.52 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  32.64 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  33.47 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.48 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.2 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  34.84 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  36.32 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  33.63 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  34.22 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  33.62 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  33.62 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.93 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  32.05 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  32.92 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.93 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.93 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  32.92 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.93 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  32.38 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.93 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.93 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.93 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.93 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  34.84 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  33.05 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  32.59 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  32.59 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7239  phosphate uptake regulator, PhoU  33.78 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  0.639643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  34.5 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  34.06 
 
 		 236 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  34.84 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  32.58 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  31.95 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  31.95 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>