25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1298 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  100 
 
 		 181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  34.13 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  32.18 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  29.24 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  30.64 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  30.34 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  28.3 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  31.94 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  32.41 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4708  hypothetical protein  28.07 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.997157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  32.41 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  27.55 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  26.83 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  29.01 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_003296  RS02975  hypothetical protein  32.16 
 
 		 180 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1681  hypothetical protein  26.9 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2305  hypothetical protein  28.7 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  36.84 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3001  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000261041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1780  hypothetical protein  24.84 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0245838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1927  hypothetical protein  24.14 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1436  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.01484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1282  hypothetical protein  23.91 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1861  putative type IV pilus assembly protein PilO  22.02 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.587528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2417  putative type IV pilus assembly protein PilO  28.04 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>