22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1338 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  28.07 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  26.97 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  28.3 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  28.93 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  32.73 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  27.27 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4708  hypothetical protein  40.85 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.997157  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  26.06 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  27.03 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  28.93 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1861  putative type IV pilus assembly protein PilO  28.29 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.587528 
 
 
-
 
NC_003296  RS02975  hypothetical protein  34.58 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2305  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  27.84 
 
 
176 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2417  putative type IV pilus assembly protein PilO  28.57 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3001  hypothetical protein  24.04 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000261041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1282  hypothetical protein  23.08 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1927  hypothetical protein  21.78 
 
 
184 aa  44.7  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>