16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3882 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  355  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  32.53 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  32.53 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  39.08 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  39.08 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  33.64 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  35.14 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  35.85 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  32.73 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  28.79 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  32.08 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  34.57 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4708  hypothetical protein  27.49 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.997157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  28.4 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  29.79 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2305  hypothetical protein  29.49 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.196819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>