18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2457 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  93.05 
 
 		 187 aa  339  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  91.98 
 
 		 187 aa  337  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  85.03 
 
 		 187 aa  283  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  53.93 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  49.32 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  39.08 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  32.73 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  38.78 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  27.62 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  25.17 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  28.09 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2305  hypothetical protein  31.13 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4708  hypothetical protein  24.68 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.997157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  27.19 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  31.51 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02975  hypothetical protein  35.42 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1681  hypothetical protein  24.04 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>