16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02975 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02975  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  353  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  34.58 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  27.53 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  28.12 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  32.71 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  35.42 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  31.88 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  30.7 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  27.1 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  25.74 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1464  putative type IV pilus assembly protein PilO  29.53 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1927  hypothetical protein  24.3 
 
 		 184 aa  44.3  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  32.93 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>