15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3226 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  373  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  39.17 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  27.78 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  31.53 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  27.88 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  27.62 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  32.43 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  28.79 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  28.91 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  29.29 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  34 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  24.59 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  26.44 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1681  hypothetical protein  25.62 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>