17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2585 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  100 
 
 
176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  34.44 
 
 
181 aa  89  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  30.48 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  27.88 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  29.28 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  32.41 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  28.09 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  31.78 
 
 
182 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  32.08 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  29.63 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  29.41 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  29.25 
 
 
193 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  30.19 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4708  hypothetical protein  31.31 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.997157  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  28.28 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02975  hypothetical protein  28.09 
 
 
180 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2305  hypothetical protein  24.21 
 
 
188 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.196819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>