17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1985 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  360  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  53.93 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  53.37 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  53.37 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  60.69 
 
 		 182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  57.93 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  35.14 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  32.41 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  27.03 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4708  hypothetical protein  26.06 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.997157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  27.33 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  27.59 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  31.63 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  29.08 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2305  hypothetical protein  30.39 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  24.07 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1681  hypothetical protein  27.36 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>