16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1681 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1927  hypothetical protein  22.53 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3001  hypothetical protein  26.57 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000261041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1282  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0134  hypothetical protein  27.89 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1780  hypothetical protein  24.16 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0245838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2417  putative type IV pilus assembly protein PilO  26.67 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1861  putative type IV pilus assembly protein PilO  22.67 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.587528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  27.43 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1578  hypothetical protein  24.85 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  26.35 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1464  putative type IV pilus assembly protein PilO  23.58 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  27.62 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  24.04 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  23.08 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  23.08 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>