13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1282 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1282  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3001  hypothetical protein  85.87 
 
 		 184 aa  298  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000261041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1927  hypothetical protein  39.67 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1861  putative type IV pilus assembly protein PilO  35.23 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.587528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1780  hypothetical protein  33.7 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0245838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2417  putative type IV pilus assembly protein PilO  33.91 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1681  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1464  putative type IV pilus assembly protein PilO  25.68 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1578  hypothetical protein  30.16 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0134  hypothetical protein  22.32 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  23.91 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  23.08 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  22.73 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>