12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2417 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2417  putative type IV pilus assembly protein PilO  100 
 
 		 181 aa  362  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1927  hypothetical protein  39.08 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1780  hypothetical protein  39.11 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0245838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1861  putative type IV pilus assembly protein PilO  38.33 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.587528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3001  hypothetical protein  36.73 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000261041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1282  hypothetical protein  36.55 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1464  putative type IV pilus assembly protein PilO  33.15 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1681  hypothetical protein  30.48 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0134  hypothetical protein  25.56 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 456 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  28.04 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>