15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4708 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4708  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  379  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.997157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2305  hypothetical protein  52.41 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  35.56 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  31.3 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  28.17 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  24.68 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  30.49 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  31.76 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  25.75 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  25.16 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  22.38 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  25.58 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  28.16 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  32.05 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  23.91 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>