16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2305 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2305  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4708  hypothetical protein  52.41 
 
 		 188 aa  170  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.997157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2457  hypothetical protein  29.31 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2291  hypothetical protein  29.31 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0517511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3480  hypothetical protein  28.74 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.627412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2617  putative transmembrane protein  30.52 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  31.5 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2466  hypothetical protein  28.24 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3226  hypothetical protein  26.16 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1985  hypothetical protein  30.39 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212863  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29120  hypothetical protein  34.12 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2416  hypothetical protein  26.67 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  27.93 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2585  transmembrane protein  22.84 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1437  hypothetical protein  26.73 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0187324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3882  hypothetical protein  29.17 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>