71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1050 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1050  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
263 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.184087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  28.57 
 
 
223 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.26 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  25.24 
 
 
427 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  30.64 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2181  glutathione S-transferase  27.46 
 
 
401 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.682429  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2133  putative glutathione S-transferase  27.46 
 
 
401 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  26.02 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0771  hypothetical protein  28.44 
 
 
404 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.383596  normal  0.439513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 
226 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  27.46 
 
 
224 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  25.65 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5006  glutathione S-transferase-like protein  25.12 
 
 
407 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061879  normal  0.748916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  26.34 
 
 
221 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  25.96 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  24.32 
 
 
237 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  29.6 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.29 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.49 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.29 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.15 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  27.92 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.19 
 
 
227 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0502  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.71 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  23.11 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4049  Glutathione S-transferase domain protein  24.38 
 
 
398 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.05 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  20.98 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4835  predicted protein  24.88 
 
 
350 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.037505  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3979  glucose-inhibited division protein A subfamily protein  23.08 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.191926 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.13 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  25.24 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  24.71 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  32.43 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  31.07 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  25.66 
 
 
223 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.36 
 
 
202 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18071  glutathione S-transferase  27.49 
 
 
417 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0908207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  28.76 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06211  glutathione S-transferase  26.92 
 
 
413 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385137  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  29.49 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  30.48 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  28.69 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  24.39 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  26 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  24.31 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05921  glutathione S-transferase  25.13 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  31.52 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  36.05 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  28.21 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.72 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.87 
 
 
200 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 
217 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  34.15 
 
 
214 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  32.43 
 
 
204 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.05 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
217 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  27.32 
 
 
217 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.76 
 
 
225 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  31.08 
 
 
209 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0002  fused glutaredoxin-like domain/phycoerythrin related domain-containing protein  24.86 
 
 
413 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  23.84 
 
 
198 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  27.04 
 
 
218 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>