More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1569 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1569  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
311 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1520  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
311 aa  620  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1671  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.18 
 
 
308 aa  358  6e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.112736  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0385  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57 
 
 
302 aa  341  9e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.48 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.08 
 
 
327 aa  199  6e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1779  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.8 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.695788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0070  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.54 
 
 
331 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1774  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.04 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1418  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.62 
 
 
361 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0333314  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.31 
 
 
333 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0457  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.54 
 
 
333 aa  178  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0109  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.19 
 
 
327 aa  178  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.2 
 
 
340 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.9 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.02 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.89 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0407  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.02 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1697  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.03 
 
 
322 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.1 
 
 
359 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.1 
 
 
359 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0052  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.56 
 
 
329 aa  170  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00129259  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1700  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.88 
 
 
329 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.28 
 
 
348 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0031  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.43 
 
 
322 aa  169  5e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.647865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.36 
 
 
333 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1514  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.88 
 
 
329 aa  168  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.78 
 
 
361 aa  168  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1881  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.19 
 
 
329 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.85 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.2 
 
 
350 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.48 
 
 
336 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.85 
 
 
348 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1104  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.65 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.45 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1979  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.8 
 
 
333 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0479133  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1984  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0608348  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.46 
 
 
363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.06 
 
 
352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2050  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.24 
 
 
331 aa  162  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.402206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.01 
 
 
353 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.7 
 
 
333 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.06 
 
 
352 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.42 
 
 
337 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.84 
 
 
348 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0656  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.86 
 
 
343 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.597374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.74 
 
 
352 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.31 
 
 
354 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.65 
 
 
342 aa  160  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0027  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.62 
 
 
340 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.59 
 
 
352 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.58 
 
 
353 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.12 
 
 
342 aa  159  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.83 
 
 
331 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.19 
 
 
357 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.84 
 
 
353 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.43 
 
 
358 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.5 
 
 
357 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.9 
 
 
352 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.48 
 
 
349 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.9 
 
 
352 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.9 
 
 
352 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0738  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.31 
 
 
354 aa  159  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.62 
 
 
340 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.06 
 
 
339 aa  158  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.58 
 
 
410 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.82 
 
 
342 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1131  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.82 
 
 
342 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.9 
 
 
340 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.46 
 
 
351 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.54 
 
 
345 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.24 
 
 
357 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.74 
 
 
345 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.88 
 
 
348 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.22 
 
 
350 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.04 
 
 
356 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.96 
 
 
369 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1156  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  33.11 
 
 
324 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.05 
 
 
350 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.85 
 
 
346 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.42 
 
 
353 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  33.91 
 
 
802 aa  156  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.67 
 
 
356 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0521  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.54 
 
 
319 aa  157  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.343824  normal  0.588771 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  34.47 
 
 
1237 aa  156  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.14 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.14 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.08 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.78 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.14 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.87 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.46 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.13 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.14 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.14 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.14 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0456  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.83 
 
 
360 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.42 
 
 
348 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17811  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.34 
 
 
347 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.62 
 
 
352 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>