More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1671 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1671  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.112736  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1520  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.18 
 
 
311 aa  358  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1569  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.18 
 
 
311 aa  358  6e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0385  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.48 
 
 
302 aa  344  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1779  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.33 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.695788  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0031  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.87 
 
 
322 aa  189  5e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.647865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.15 
 
 
327 aa  186  6e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.41 
 
 
331 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.14 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.48 
 
 
363 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.48 
 
 
352 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0070  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.76 
 
 
331 aa  175  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1774  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.14 
 
 
327 aa  175  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.88 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.67 
 
 
363 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0052  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.33 
 
 
329 aa  170  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00129259  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.4 
 
 
333 aa  170  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2050  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.76 
 
 
331 aa  168  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.402206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.53 
 
 
363 aa  169  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.08 
 
 
361 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.14 
 
 
342 aa  168  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.18 
 
 
336 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.93 
 
 
340 aa  166  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1700  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.81 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1418  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.14 
 
 
361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0333314  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1514  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.81 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0407  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.36 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.96 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.88 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.71 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.67 
 
 
345 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.39 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.15 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.35 
 
 
348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.44 
 
 
348 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1881  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.19 
 
 
329 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0457  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  33.33 
 
 
333 aa  162  9e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.19 
 
 
342 aa  161  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  32.94 
 
 
802 aa  160  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0568  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.86 
 
 
349 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.23 
 
 
345 aa  160  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.6 
 
 
347 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.82 
 
 
345 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.09 
 
 
351 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.91 
 
 
363 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.29 
 
 
357 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0109  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.13 
 
 
327 aa  159  6e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  31.8 
 
 
350 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  31.68 
 
 
354 aa  159  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.95 
 
 
352 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  33.33 
 
 
345 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0175962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36 
 
 
345 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.33 
 
 
349 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.33 
 
 
357 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36 
 
 
345 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.06 
 
 
345 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.02 
 
 
357 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1979  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.2 
 
 
333 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0479133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.33 
 
 
349 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36 
 
 
345 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.26 
 
 
345 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36 
 
 
345 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36 
 
 
345 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  34.07 
 
 
1237 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36 
 
 
345 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  36 
 
 
345 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36 
 
 
345 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.19 
 
 
345 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.28 
 
 
345 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  32.23 
 
 
379 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  32.59 
 
 
337 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36 
 
 
345 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0072  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  32.83 
 
 
358 aa  157  3e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1611  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.64 
 
 
338 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0206763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.77 
 
 
351 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.693195  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.67 
 
 
349 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.53 
 
 
353 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  33.33 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0588894  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0516  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.19 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.706713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.91 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  31.18 
 
 
357 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1156  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  34.81 
 
 
324 aa  155  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.18 
 
 
348 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.8 
 
 
359 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  30.58 
 
 
350 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  31.1 
 
 
357 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.8 
 
 
359 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0337  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.5 
 
 
349 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.112508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.37 
 
 
351 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.69 
 
 
351 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1419  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.5 
 
 
349 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  32.5 
 
 
357 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0738  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  32.14 
 
 
354 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2623  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  33.77 
 
 
353 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  0.159504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.71 
 
 
356 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  32.09 
 
 
357 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.02 
 
 
333 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  31.94 
 
 
353 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  32.59 
 
 
353 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3759  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  31.66 
 
 
356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261432  normal  0.953602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>