More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0862 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
333 aa  669    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1979  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  78.61 
 
 
333 aa  546  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0479133  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1252  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.23 
 
 
332 aa  447  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.850982  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0223  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.64 
 
 
332 aa  350  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.707619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.22 
 
 
330 aa  322  6e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457574  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0400  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.22 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.243821 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1156  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.78 
 
 
324 aa  318  7e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0143  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50 
 
 
331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3055  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.46 
 
 
330 aa  310  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1625  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.38 
 
 
330 aa  308  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.12 
 
 
343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454531  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3493  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.38 
 
 
333 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2746  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.5 
 
 
329 aa  295  6e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0568  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.87 
 
 
349 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0433  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.91 
 
 
343 aa  289  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0500  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.38 
 
 
349 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.927919  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0337  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.13 
 
 
349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.112508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1419  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.43 
 
 
349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0810  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.77 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.128611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0582  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.82 
 
 
340 aa  263  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1984  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.52 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0608348  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.58 
 
 
358 aa  225  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0407  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.43 
 
 
336 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.4 
 
 
369 aa  221  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1697  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.79 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.18 
 
 
336 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.12 
 
 
333 aa  218  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.25 
 
 
331 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0456  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.38 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.38 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.88 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.88 
 
 
363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.88 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.44 
 
 
340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.26 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.26 
 
 
349 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40 
 
 
348 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0072  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.31 
 
 
358 aa  210  3e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.75 
 
 
356 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40 
 
 
348 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.08 
 
 
345 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.99 
 
 
353 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40 
 
 
341 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.12 
 
 
345 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.65 
 
 
345 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.18 
 
 
348 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.78 
 
 
363 aa  206  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.82 
 
 
346 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.2 
 
 
354 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.7 
 
 
345 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.81 
 
 
349 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.49 
 
 
359 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.79 
 
 
333 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.99 
 
 
333 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.43 
 
 
345 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.43 
 
 
345 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.43 
 
 
345 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.43 
 
 
345 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  40.43 
 
 
345 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.43 
 
 
345 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.66 
 
 
359 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.43 
 
 
345 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.43 
 
 
345 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.73 
 
 
345 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.25 
 
 
346 aa  203  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.18 
 
 
346 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.96 
 
 
347 aa  202  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.53 
 
 
349 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.96 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.56 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.96 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.12 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.82 
 
 
346 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.18 
 
 
347 aa  200  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.58 
 
 
345 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.92 
 
 
345 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.5 
 
 
352 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.82 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.81 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  34.88 
 
 
342 aa  199  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.65 
 
 
345 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.11 
 
 
353 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.99 
 
 
355 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.73 
 
 
350 aa  198  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.15 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0738  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.61 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.95 
 
 
368 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.83 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.42 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  40.06 
 
 
1237 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.66 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2617  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.99 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.167412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.41 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.87 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.25 
 
 
347 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.45 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2487  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.12 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.44 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.51 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.68 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>