More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1984 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1984  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
323 aa  652    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0608348  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1697  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.68 
 
 
322 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0582  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.09 
 
 
340 aa  264  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0568  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.83 
 
 
349 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0337  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.14 
 
 
349 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.112508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1419  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.83 
 
 
349 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0810  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.04 
 
 
351 aa  246  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.128611  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0500  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.21 
 
 
349 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.927919  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1979  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.28 
 
 
333 aa  238  9e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0479133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.52 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1252  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.38 
 
 
332 aa  229  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.850982  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1156  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.87 
 
 
324 aa  222  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0665  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.12 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0223  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.86 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.707619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0400  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.25 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.243821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.95 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.24 
 
 
330 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457574  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1625  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.24 
 
 
330 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2746  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.27 
 
 
329 aa  209  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0143  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.38 
 
 
331 aa  208  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3055  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.77 
 
 
330 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1903  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.48 
 
 
307 aa  208  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.286621 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2191  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.75 
 
 
309 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.99 
 
 
309 aa  204  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3493  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.24 
 
 
333 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0110  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.03 
 
 
307 aa  203  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0846572  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.39 
 
 
343 aa  202  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454531  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.05 
 
 
333 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.41 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0433  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.93 
 
 
343 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.21 
 
 
344 aa  192  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.16 
 
 
336 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.81 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.98 
 
 
346 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1104  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.76 
 
 
339 aa  189  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0759  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.39 
 
 
331 aa  189  8e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.37 
 
 
333 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.41 
 
 
346 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0407  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.95 
 
 
336 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.16 
 
 
349 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1779  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.73 
 
 
322 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.695788  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1131  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.29 
 
 
342 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.29 
 
 
342 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.86 
 
 
354 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0656  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.66 
 
 
343 aa  186  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.597374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0456  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.52 
 
 
360 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1416  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.07 
 
 
340 aa  185  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.578384  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  35.6 
 
 
340 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.65 
 
 
350 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.97 
 
 
350 aa  185  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.65 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1611  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.02 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0206763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.32 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0325  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.5 
 
 
346 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.66 
 
 
358 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.54 
 
 
341 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.5 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0369  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.62 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0027  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.05 
 
 
340 aa  182  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1131  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.88 
 
 
328 aa  182  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.417766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.83 
 
 
354 aa  182  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.46 
 
 
362 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0588894  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.84 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.62 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.15 
 
 
342 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0271  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.19 
 
 
346 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2617  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.02 
 
 
343 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.167412  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3499  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.02 
 
 
343 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.5 
 
 
340 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0275  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.75 
 
 
347 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.19 
 
 
346 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.78 
 
 
345 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0283  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.31 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0268  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.31 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0296  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.31 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0328  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.31 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4978  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.31 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0075  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.11 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496128  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.07 
 
 
352 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.91 
 
 
347 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0070  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.92 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.23 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.14 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.3 
 
 
350 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.58 
 
 
347 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.58 
 
 
347 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.46 
 
 
369 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.88 
 
 
350 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.07 
 
 
352 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  31.7 
 
 
342 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.36 
 
 
340 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.58 
 
 
351 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0031  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.22 
 
 
322 aa  177  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.647865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.78 
 
 
345 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.78 
 
 
345 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1514  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.97 
 
 
329 aa  176  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.07 
 
 
352 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.07 
 
 
352 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  35.07 
 
 
352 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.06 
 
 
345 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>