More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0656 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0656  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
343 aa  699    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.597374  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1131  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  77.49 
 
 
342 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  77.49 
 
 
342 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.1 
 
 
346 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.53 
 
 
345 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.42 
 
 
346 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.51 
 
 
379 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.59 
 
 
345 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0027  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.63 
 
 
340 aa  364  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.69 
 
 
359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.79 
 
 
346 aa  361  9e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.15 
 
 
345 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.41 
 
 
346 aa  359  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0275  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
347 aa  358  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.05 
 
 
347 aa  358  8e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.22 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.75 
 
 
345 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0268  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.19 
 
 
346 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
345 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.15 
 
 
348 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.1 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.84 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0283  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.89 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0296  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.89 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4978  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.19 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0328  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.89 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.1 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.84 
 
 
345 aa  352  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.84 
 
 
345 aa  352  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.03 
 
 
346 aa  352  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.84 
 
 
350 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.99 
 
 
345 aa  352  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.84 
 
 
345 aa  352  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0369  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.89 
 
 
346 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  52.84 
 
 
345 aa  352  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.84 
 
 
345 aa  352  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.84 
 
 
345 aa  352  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
346 aa  352  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.84 
 
 
345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0271  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.89 
 
 
346 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.91 
 
 
345 aa  352  8e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.73 
 
 
352 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.03 
 
 
346 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.54 
 
 
345 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.44 
 
 
346 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.05 
 
 
363 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0325  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.59 
 
 
346 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.94 
 
 
355 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.11 
 
 
345 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.59 
 
 
346 aa  349  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.73 
 
 
352 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.29 
 
 
346 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0399  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.3 
 
 
342 aa  349  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.862659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.2 
 
 
352 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.76 
 
 
354 aa  349  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.84 
 
 
350 aa  348  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.34 
 
 
369 aa  348  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.15 
 
 
352 aa  347  1e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.12 
 
 
340 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.84 
 
 
363 aa  347  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.4 
 
 
337 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.08 
 
 
349 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.89 
 
 
356 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.22 
 
 
352 aa  346  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.29 
 
 
345 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.74 
 
 
346 aa  346  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.94 
 
 
345 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.34 
 
 
358 aa  345  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.07 
 
 
345 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.64 
 
 
345 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
346 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.64 
 
 
350 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.37 
 
 
345 aa  344  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.64 
 
 
345 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.37 
 
 
347 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0879  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.87 
 
 
345 aa  344  1e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.64 
 
 
345 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.64 
 
 
350 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.45 
 
 
346 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0052  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.82 
 
 
339 aa  343  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.79 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.37 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.33 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.6 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.37 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.41 
 
 
348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.41 
 
 
348 aa  342  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.13 
 
 
345 aa  342  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.52 
 
 
353 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.12 
 
 
352 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.94 
 
 
341 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.29 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.29 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.29 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.52 
 
 
352 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.2 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.39 
 
 
350 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.1 
 
 
353 aa  339  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.29 
 
 
345 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.29 
 
 
345 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>