72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3415 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3415  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324486  normal  0.468365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1799  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  49.22 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2387  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  45.62 
 
 		 277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1597  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  45.63 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000998757  normal  0.0301859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1571  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  49.4 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.470446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0813  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  47.66 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1713  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  44.23 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331936  normal  0.0300311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2537  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  46.9 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0946412  normal  0.964956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3364  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.3 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3561  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.3 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.14939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3436  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.3 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0636806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.3 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0942  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  41.86 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0138824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2162  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  47.89 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25320  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  48.66 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0976  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.02 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0590334  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.02 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1105  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.02 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14610  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  44.96 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.02 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0376785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1929  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  45.08 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0388168  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  42.42 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2426  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.33 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1882  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.92 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  42.35 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3101  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  44.57 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0984  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.8 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000820153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  42.91 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  41.67 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00248984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  44.19 
 
 		 264 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.079806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03273  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.02 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0098  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  41.41 
 
 		 287 aa  201  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3315  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  45.7 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000493084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3303  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  45.31 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3164  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  45.31 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.787617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3615  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.41 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00282585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2879  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  41 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.566185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0955  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  45.21 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00747  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  40.87 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213256  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1691  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  41.41 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.517966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1082  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  39 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0454  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  40.71 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  41.34 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3270  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.34 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.707847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3493  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.34 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3562  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.74 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0750  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.94 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3209  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.68 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0626162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3683  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.34 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.448875  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3376  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.54 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0756  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.34 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0904  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.73 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0851  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.73 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.293062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3580  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.65 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.73 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2979  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.13 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1575  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.98 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3403  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  32.14 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0605774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2136  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  31.74 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000237861  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  30.67 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0551  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.37 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.726956  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2180  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  29.92 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2538  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  29.34 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.645341  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12153  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.09 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0039  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  35.71 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.66 
 
 		 193 aa  42.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.03 
 
 		 190 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.68 
 
 		 185 aa  42  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>