74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3683 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3683  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.448875  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3562  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  98.51 
 
 
268 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0756  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  98.51 
 
 
268 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3493  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  97.39 
 
 
268 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3376  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  93.51 
 
 
264 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3270  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  93.13 
 
 
264 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.707847  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0750  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  92.75 
 
 
264 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0904  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  92.37 
 
 
264 aa  500  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0851  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  91.25 
 
 
264 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.293062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3580  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  72.83 
 
 
256 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  72.83 
 
 
256 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3403  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  70.87 
 
 
256 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0605774  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3209  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  67.19 
 
 
255 aa  374  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0626162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1575  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  68.48 
 
 
259 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2979  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  59.29 
 
 
254 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  43.31 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2537  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  40.23 
 
 
265 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0946412  normal  0.964956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1082  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  39.53 
 
 
256 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0942  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.13 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0138824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.13 
 
 
262 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0315347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0976  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.13 
 
 
262 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0590334  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.13 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0376785  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1105  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.74 
 
 
262 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3561  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.55 
 
 
262 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.14939  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.55 
 
 
262 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3364  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.55 
 
 
262 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699849  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3436  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.55 
 
 
262 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0636806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3101  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  39.08 
 
 
264 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1882  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  39.61 
 
 
257 aa  191  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.31 
 
 
264 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.079806  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0984  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.31 
 
 
265 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000820153  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1691  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.96 
 
 
258 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.517966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.4 
 
 
256 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3615  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.55 
 
 
264 aa  184  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00282585  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2879  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.93 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.566185  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.4 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00248984  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1713  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  37.17 
 
 
266 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331936  normal  0.0300311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03273  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.21 
 
 
261 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1597  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.98 
 
 
262 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000998757  normal  0.0301859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14610  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.85 
 
 
262 aa  174  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0955  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.04 
 
 
264 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0813  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.86 
 
 
261 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1799  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.65 
 
 
258 aa  168  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3315  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.9 
 
 
266 aa  168  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000493084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3303  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.9 
 
 
266 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3164  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.9 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.787617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.29 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1929  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.08 
 
 
267 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0388168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0454  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.06 
 
 
253 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2387  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.33 
 
 
277 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3415  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.34 
 
 
270 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324486  normal  0.468365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2162  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.61 
 
 
261 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25320  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.03 
 
 
261 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.57 
 
 
310 aa  148  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2426  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  32.17 
 
 
310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00747  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.47 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0098  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.27 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1571  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.37 
 
 
256 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.470446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2136  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  36.28 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000237861  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2538  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  25.43 
 
 
247 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.645341  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  38.3 
 
 
208 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0551  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.82 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.726956  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2180  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.68 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0039  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.09 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12153  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.63 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  32.11 
 
 
199 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  26.88 
 
 
203 aa  56.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  22.46 
 
 
202 aa  52.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  32.99 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0063  FMN-binding domain-containing protein  35.14 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.650559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.89 
 
 
196 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.46 
 
 
368 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  28.8 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.8 
 
 
580 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>