79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002709 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  100 
 
 		 256 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03273  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  80.46 
 
 		 261 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1882  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  77.82 
 
 		 257 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  69.14 
 
 		 256 aa  360  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  61.18 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00248984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3303  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  58.98 
 
 		 266 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3315  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  58.98 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000493084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3164  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  58.98 
 
 		 266 aa  298  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.787617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0955  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  60.7 
 
 		 264 aa  297  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  53.99 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3364  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  54.17 
 
 		 262 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3561  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  54.17 
 
 		 262 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.14939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  54.17 
 
 		 262 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3436  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  54.17 
 
 		 262 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0636806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  53.03 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0976  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  53.03 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0590334  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  53.03 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0376785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0942  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  52.65 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0138824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2879  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  52.26 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.566185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1105  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  51.89 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  53.76 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.079806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1082  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  50 
 
 		 256 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1691  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  47.24 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.517966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3615  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  51.13 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00282585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3101  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  50.75 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0984  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  49.44 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000820153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1713  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  49.24 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331936  normal  0.0300311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2537  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  50.94 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0946412  normal  0.964956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0454  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  51 
 
 		 253 aa  248  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00747  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  48.21 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14610  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  46.54 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1597  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  46.74 
 
 		 262 aa  235  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000998757  normal  0.0301859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1799  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  48.64 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1571  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  49.8 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.470446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0813  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  46.09 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1929  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  44.03 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0388168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2387  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  44.36 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2162  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  44.02 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3403  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  40.7 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0605774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25320  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  44.02 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3415  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  42.91 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324486  normal  0.468365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3209  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  39.36 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0626162  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0851  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.19 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.293062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1575  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.61 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3270  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.19 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.707847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0750  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.19 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3376  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.8 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3683  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.4 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.448875  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0904  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.01 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3493  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.4 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0756  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.4 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3562  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.4 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0098  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  41.42 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.21 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3580  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.43 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2426  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  41.13 
 
 		 310 aa  175  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  40.15 
 
 		 310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2979  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.33 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2136  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  30.84 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000237861  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  29.54 
 
 		 208 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2180  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.1 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2538  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  30.74 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.645341  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0551  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  39.2 
 
 		 318 aa  95.9  5e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.726956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12153  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.5 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0039  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.3 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  32.8 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.91 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.04 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.09 
 
 		 344 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.26 
 
 		 368 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.84 
 
 		 580 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  28.97 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.09 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.34 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  34.83 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.03 
 
 		 178 aa  42  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>