70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3209 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3209  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0626162  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3270  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  67.19 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.707847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0750  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  67.19 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3562  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  67.59 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3376  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  67.19 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3683  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  67.19 
 
 		 268 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.448875  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0904  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  66.14 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0756  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  66.8 
 
 		 268 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3493  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  66.8 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0851  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  67.33 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.293062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3403  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  65.61 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0605774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  66.01 
 
 		 256 aa  360  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3580  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  62.85 
 
 		 256 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1575  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  60.94 
 
 		 259 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2979  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  61.96 
 
 		 254 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1082  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  40.32 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  38.58 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2537  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.35 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0946412  normal  0.964956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0942  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.36 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0138824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.61 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0976  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.61 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0590334  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.61 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0376785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1105  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.36 
 
 		 262 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0984  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.58 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000820153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  39.36 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3101  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.96 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3364  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.04 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.04 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3561  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.04 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.14939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3436  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.04 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0636806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.12 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.079806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1691  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.65 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.517966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2879  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.35 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.566185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03273  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  37.94 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1882  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.8 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3615  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.02 
 
 		 264 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00282585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14610  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.47 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.96 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00248984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0813  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.05 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1597  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.08 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000998757  normal  0.0301859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0951  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.61 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1713  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  36.09 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331936  normal  0.0300311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0454  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.32 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0955  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.55 
 
 		 264 aa  164  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1799  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.99 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3303  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.54 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3315  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.54 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000493084 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3415  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.68 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324486  normal  0.468365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3164  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.14 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.787617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2387  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.27 
 
 		 277 aa  151  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1929  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.21 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0388168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25320  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.33 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2162  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  32.49 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00747  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  30.31 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213256  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2426  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.73 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.37 
 
 		 310 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0098  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.75 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1571  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.34 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.470446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2136  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  26.92 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000237861  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_002620  TC0551  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.57 
 
 		 318 aa  87.8  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.726956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  34.91 
 
 		 208 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2538  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  26.64 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.645341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2180  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  24.58 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0039  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.24 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12153  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.67 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0063  FMN-binding domain-containing protein  34.58 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.650559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  27.1 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>