34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1832 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1126    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  52.55 
 
 		 545 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  45.64 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  46.31 
 
 		 546 aa  432  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  44.32 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  43.28 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  44.3 
 
 		 561 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  43.75 
 
 		 574 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  35.79 
 
 		 566 aa  317  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  34.43 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  34.43 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  34.43 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  34.88 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  34.53 
 
 		 573 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  34.08 
 
 		 629 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  33.27 
 
 		 587 aa  277  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  32.45 
 
 		 569 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  34.28 
 
 		 563 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  34.28 
 
 		 565 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  34.28 
 
 		 565 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  33.02 
 
 		 587 aa  272  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  32.27 
 
 		 570 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  32.85 
 
 		 573 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  33.82 
 
 		 579 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  33.89 
 
 		 585 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  33.01 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  30.87 
 
 		 627 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  31.31 
 
 		 643 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  32.42 
 
 		 572 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  31.19 
 
 		 567 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  30.28 
 
 		 672 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  32.75 
 
 		 695 aa  98.2  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  25.27 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  22.09 
 
 		 389 aa  47.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>