34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  100 
 
 		 643 aa  1263    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  43.98 
 
 		 582 aa  442  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  44.3 
 
 		 570 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  43.64 
 
 		 569 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  42.91 
 
 		 566 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  45.19 
 
 		 579 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  43.66 
 
 		 563 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  42.81 
 
 		 587 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  43.66 
 
 		 565 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  43.66 
 
 		 565 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  41.11 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  41.11 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  41.11 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  42.8 
 
 		 587 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  42.61 
 
 		 599 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  41.5 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  40.44 
 
 		 629 aa  365  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  41.3 
 
 		 573 aa  359  8e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  38.22 
 
 		 573 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  43.81 
 
 		 567 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  38.05 
 
 		 572 aa  329  8e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  47.72 
 
 		 627 aa  327  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  37.59 
 
 		 540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  37.77 
 
 		 546 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  35.84 
 
 		 559 aa  293  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  35.33 
 
 		 561 aa  287  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  35.27 
 
 		 564 aa  279  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  34.38 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  34.7 
 
 		 574 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  31.31 
 
 		 558 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  32.68 
 
 		 695 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  30.54 
 
 		 672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  27.17 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  26.02 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>