34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5118 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  71.75 
 
 
585 aa  836    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  71.75 
 
 
585 aa  836    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1150    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  78.71 
 
 
573 aa  890    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  71.75 
 
 
585 aa  836    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  48.06 
 
 
629 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  46.49 
 
 
566 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  43.64 
 
 
587 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  41.32 
 
 
570 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  42.11 
 
 
569 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  41.31 
 
 
585 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  43.82 
 
 
563 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  43.74 
 
 
565 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  43.74 
 
 
565 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  40.25 
 
 
587 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  37.75 
 
 
582 aa  362  7.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  39.74 
 
 
579 aa  359  8e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  38.94 
 
 
643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  40.04 
 
 
599 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  37.89 
 
 
540 aa  343  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  37.66 
 
 
559 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  38.74 
 
 
627 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  35.98 
 
 
546 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  37.28 
 
 
574 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  40.07 
 
 
567 aa  314  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  35.32 
 
 
564 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  36.03 
 
 
545 aa  301  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  34.53 
 
 
561 aa  299  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  34.93 
 
 
572 aa  294  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  33.7 
 
 
558 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  32.02 
 
 
695 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  30.25 
 
 
672 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  28.52 
 
 
398 aa  94  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  23.48 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>