34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2200 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1117    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  56.75 
 
 		 546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  56.53 
 
 		 561 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  53.03 
 
 		 564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  55.22 
 
 		 574 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  55.72 
 
 		 540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  43.97 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  43.41 
 
 		 558 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  38.97 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  40.83 
 
 		 566 aa  365  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  36.41 
 
 		 570 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  38.52 
 
 		 573 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  36.2 
 
 		 569 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  36.95 
 
 		 585 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  36.95 
 
 		 585 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  36.95 
 
 		 585 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  39.21 
 
 		 599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  37.43 
 
 		 585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  37.82 
 
 		 563 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  37.99 
 
 		 565 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  37.99 
 
 		 565 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  37.29 
 
 		 573 aa  329  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  36.38 
 
 		 582 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  36.47 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  35.87 
 
 		 627 aa  303  8.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  35.41 
 
 		 629 aa  301  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  35.84 
 
 		 643 aa  297  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  35.46 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  36.07 
 
 		 567 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  30.57 
 
 		 572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  34.15 
 
 		 695 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  30 
 
 		 672 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  30.32 
 
 		 398 aa  90.5  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  24.9 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>