34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4682 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  79.26 
 
 
563 aa  810    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  65.38 
 
 
627 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  72.03 
 
 
587 aa  799    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  79.3 
 
 
565 aa  820    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  85.54 
 
 
569 aa  959    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1146    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  79.3 
 
 
565 aa  820    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  58.03 
 
 
599 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  46.18 
 
 
566 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  43.73 
 
 
643 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  43.19 
 
 
587 aa  412  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  41.95 
 
 
585 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  41.92 
 
 
585 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  41.92 
 
 
585 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  41.92 
 
 
585 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  43.73 
 
 
579 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  42.08 
 
 
629 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  40.93 
 
 
573 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  39.27 
 
 
582 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  40.77 
 
 
573 aa  369  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  38.42 
 
 
546 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  36.41 
 
 
559 aa  349  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  37.78 
 
 
540 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  36.36 
 
 
561 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  37.11 
 
 
564 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  37.5 
 
 
567 aa  306  7e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  35.48 
 
 
572 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  35.3 
 
 
574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  34.67 
 
 
545 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  33.15 
 
 
558 aa  279  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  30.99 
 
 
695 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  30.28 
 
 
672 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  28.73 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  24.07 
 
 
389 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>