34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0739 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1157    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  55.66 
 
 
579 aa  571  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  43.98 
 
 
643 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  42.24 
 
 
566 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  41.07 
 
 
585 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  41.47 
 
 
587 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  43.14 
 
 
567 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  38.17 
 
 
585 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  38.17 
 
 
585 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  38.17 
 
 
585 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  39.93 
 
 
569 aa  365  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  39.44 
 
 
587 aa  365  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  38.52 
 
 
570 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  39.85 
 
 
573 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  39.85 
 
 
599 aa  363  6e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  41.42 
 
 
540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  40.5 
 
 
563 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  40.5 
 
 
565 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  40.5 
 
 
565 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  37.36 
 
 
629 aa  350  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  36.87 
 
 
573 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  40.25 
 
 
546 aa  342  7e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  40.3 
 
 
572 aa  330  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  37.84 
 
 
561 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  37.77 
 
 
627 aa  316  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  36.09 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  34.88 
 
 
558 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  34.95 
 
 
564 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  35.03 
 
 
574 aa  277  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  30.91 
 
 
545 aa  267  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  29.4 
 
 
695 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  29.41 
 
 
672 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  28.46 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  28.9 
 
 
389 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>